《中国(上海)自由贸易试验区临港新片区总体方案》明确，在新片区内设立物理围网区域，建立洋山特殊综合保税区，作为对标国际公认、竞争力最强自由贸易园区的重要载体，实施更高水平的贸易自由化便利化政策和制度。2020年1月，国务院正式批复同意设立洋山特殊综合保税区。根据批复要求，洋山特殊综合保税区规划面积25.31平方公里，包括芦潮港区域、小洋山岛区域、浦东机场南部区域等三个区域，共五个区块。洋山特殊综合保税区是我国目前海关特殊监管区中唯 一的特殊综合保税区。

洋山特殊综合保税区包括芦潮港、小洋山岛以及浦东机场南部三个区域,主要以原洋山保税港区为基础，并拓展至洋山深水港四期、上海南港区块以及浦东机场南部区域。其中，芦潮港区域主要由原洋山保税港区陆域和上海南港区块组成;小洋山岛区域主要由原洋山保税港区岛域(洋山深水港1-3期)和洋山深水港4期组成;浦东机场南部区域主要包括商飞基地等区块。

原洋山保税港区建立于2005年，是全国第 一个“区港一体”的保税港区，作为上海建设国际航运中心的核心功能区，经过15年的开发建设，经济规模、功能模式、业务创新及企业集聚在全国处于领先地位，是全国14家保税港区中发展最快、效益最 好的保税港区。洋山深水港四期是全球规模最 大的自动化码头。上海南港区块毗邻上海南港这一上海东南部地区唯 一的陆地公共港区。浦东机场南部区域初步集聚了以商飞公司大飞机总装制造和机场集团航空物流为主的航空产业链。

(一)芦潮港区域

芦潮港区域规划面积7.99平方公里，包括原洋山保税港区陆域6.83平方公里和上海南港区块1.16平方公里。该区域远期将拓展至原洋山保税港区陆域3.63平方公里发展备用地块。

原洋山保税港区陆域开发程度相对成熟。6.83平方公里已开发建设6.09平方公里,主要包括查验区、港口辅助区、仓储配送区、集拼中转区、加工制造区、商贸展示区等功能区域,已建成仓库建筑面积189万平方米、商务办公楼宇约20万平方米。

原洋山保税港区陆域经济发展态势良好。截止2019年底，区内注册企业1721家，在航运物流、汽车零配件、跨境电商、保税维修、大宗商品交易、生鲜冷链等领域已经形成产业集聚优势，区域经济发展稳中有进。2019年，地区生产总值350亿元，工商税收120.7亿元。

原洋山保税港区陆域产业功能较为丰富。特别是自贸试验区建设以来，率先开展了货物状态分类监管、增值税一般纳税人、国际中转集拼、全球检测维修等试点，基本形成了面向欧美的分拨配送基地、大宗商品产业基地、面向国内的进口贸易基地、船舶维修检测基地以及航运龙头企业集聚地。区域率先开展期货保税交割试点，设立保税交割仓库，推出了铜、镍、铅、锌等期货保税交割品种，创设“洋山铜溢价”，并率先开展期货保税仓单质押业务。区域率先建设了大宗商品国际现货交易平台，已引进瑞士摩科瑞能源、法国路易达孚、荷兰世天威、五矿有色、山东黄金、中能煤业、江西铜业等行业龙头企业310余家，2019年大宗商品销售额超过2000亿元。

上海南港区域1.16平方公里、原洋山保税港区陆域3.63平方公里发展备用地块，尚待开发建设。

(二)小洋山岛区域

小洋山岛区域规划面积9.46平方公里，包括原洋山保税港区岛域(洋山深水港1-3期)以及洋山深水港4期等区块。该区域远期将规划至小洋山岛北侧区域。

依托原洋山保税港区国际中转集拼、保税船舶登记、启运港退税等政策优势和洋山深水港区位优势，洋山深水港的国际枢纽地位进一步巩固。目前，洋山深水港拥有70余条国际航线，每月国际航班达320余班，覆盖地中海、美西、美东、南美、南非、澳洲、欧洲、东南亚、黑海和波斯湾等贸易区，“水水中转”和“国际中转”比重大幅提升。2019年，洋山深水港吞吐量达到1980.8万标准箱，同比增长7.59%。

(三)浦东机场南部区域

浦东机场南部区域规划面积7.86平方公里，主要包括商飞基地等地块。商飞基地主要负责ARJ21新支线飞机和C919大型客机的总装集成、C929宽体客机的项目研制、复合材料零部件研制等任务以及维修、交付与改装等任务。基地已基本形成以大飞机总装制造为龙头的航空制造产业链。2019年，该区域实现工业总产值67.8亿元。

(四)区外联动发展重点产业

为支持和促进临港新片区具有国际竞争力的重点产业、重点企业高质量发展，海关总署根据企业业务特点，允许设立在临港新片区规划范围内洋山特殊综合保税区外的企业，依申请享受电子监管、创新检验检疫方式、简化海关手(账)册管理、试行企业集团化保税监管等海关特殊监管政策。主要是面向集成电路、人工智能、生物医药、民用航空等关键领域核心环节生产研发的重点企业。目前已有部分企业获批。